在蛋白質(zhì)中存在多種非共價(jià)相互作用協(xié)同工作進(jìn)而穩(wěn)定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的功能,其中,范德華作用是一種不可忽視的作用力,但定量測(cè)量十分困難。跨范德華力的J-耦合常數(shù)的檢測(cè)為研究范德華力提供了新的信息,雖然已經(jīng)有相關(guān)理論研究報(bào)道,但在蛋白質(zhì)中的直接檢測(cè)還未能實(shí)現(xiàn)。近日,青島能源所蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)研究組發(fā)展了一種新的核磁共振方法,通過(guò)檢測(cè)蛋白質(zhì)甲基基團(tuán)碳原子與其它脂肪族側(cè)鏈碳原子之間的跨范德華力的J-耦合常數(shù),首次實(shí)現(xiàn)了對(duì)蛋白質(zhì)中范德華作用的定量解析。相關(guān)研究成果已發(fā)表于Journal of the American Chemical Society雜志上(JACS 2018,140: 3194.)
該研究以IgG結(jié)合蛋白質(zhì)GB3為研究對(duì)象,通過(guò)對(duì)亮氨酸、異亮氨酸和纈氨酸的甲基進(jìn)行[13C, 1H]選擇性標(biāo)記(對(duì)其它氨基酸進(jìn)行[13C, 2H]標(biāo)記),設(shè)計(jì)HMQC實(shí)驗(yàn)脈沖序列,利用其較長(zhǎng)的徑向弛豫時(shí)間來(lái)實(shí)現(xiàn)磁化矢量從甲基碳原子到脂肪族側(cè)鏈碳原子上的傳遞(圖1),從而實(shí)現(xiàn)跨范德華力的JCC-耦合常數(shù)測(cè)量(數(shù)值在~0.1-0.6 Hz之間)。進(jìn)一步的量子力學(xué)計(jì)算表明,跨范德華力的JCC-耦合常數(shù)與范德華力的交換互斥力組分正相關(guān)(另一重要范德華力組分是色散作用力)。
該工作首次實(shí)現(xiàn)了蛋白質(zhì)跨范德華力的JCC-耦合常數(shù)測(cè)量,并對(duì)其來(lái)源機(jī)制進(jìn)行了解析,為證明蛋白質(zhì)中范德華作用存在提供了直接的實(shí)驗(yàn)證據(jù),也為理解分析蛋白質(zhì)中的非共價(jià)作用提供了新的思路。
以上研究由中國(guó)科學(xué)院青島能源所蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)研究組姚禮山研究員主持完成,獲得國(guó)家自然科學(xué)基金的支持,部分實(shí)驗(yàn)在科學(xué)島穩(wěn)態(tài)強(qiáng)磁場(chǎng)實(shí)驗(yàn)裝置核磁共振譜儀系統(tǒng)上完成。
蛋白質(zhì)內(nèi)部跨范德華力的JCC-耦合常數(shù)測(cè)量