近期,中國(guó)科學(xué)院合肥腫瘤醫(yī)院腫瘤轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心在小細(xì)胞肺癌化療耐藥研究領(lǐng)域取得新進(jìn)展。研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析和驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)PCDHB4基因的高表達(dá)與接受化療的小細(xì)胞肺癌患者較差的生存率密切相關(guān)。相關(guān)研究成果發(fā)表在Cell Press旗下期刊iScience。
小細(xì)胞肺癌是一種惡性程度很高的肺癌亞型,化療耐藥是小細(xì)胞肺癌治療的主要臨床問(wèn)題。在本研究中,研究團(tuán)隊(duì)利用轉(zhuǎn)錄組和甲基化組學(xué)數(shù)據(jù)的整合分析,發(fā)現(xiàn)PCDHB4基因的高表達(dá)與接受化療的小細(xì)胞肺癌患者的較差生存率密切相關(guān)。進(jìn)一步研究使用臨床樣本和細(xì)胞系,驗(yàn)證了PCDHB4基因在小細(xì)胞肺癌中呈現(xiàn)低甲基化和高表達(dá)的狀態(tài),并且導(dǎo)致小細(xì)胞肺癌化療耐藥。機(jī)制上,通過(guò)對(duì)bulk RNA-seq和single cell RNA-seq測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)PCDHB4高表達(dá)的小細(xì)胞肺癌與較低的免疫浸潤(rùn)相關(guān),并且高表達(dá)PCDHB4的小細(xì)胞肺癌具有干性(stemness)和上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)的特征。總之,PCDHB4基因有望成為預(yù)測(cè)小細(xì)胞肺癌化療耐藥的潛在預(yù)后標(biāo)志物。
該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金,安徽省臨床醫(yī)學(xué)研究轉(zhuǎn)化專項(xiàng)和中國(guó)科學(xué)院合肥大科學(xué)中心“協(xié)同創(chuàng)新培育基金”等項(xiàng)目的資助。
文章鏈接:https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(24)01638-9
PCDHB4基因的低甲基化和高表達(dá)與小細(xì)胞肺癌化療耐藥和預(yù)后密切相關(guān)