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        科研進展

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        SHMFF用戶應用液體核磁刻畫CTCF多點識別DNA的動態特性

        作者:趙宏鑫發布時間:2018-07-11【打印】【關閉】
          穩態強磁場實驗裝置(SHMFF)用戶中科大生命科學學院施蘊渝院士/吳季輝教授團隊的阮科副教授和張志勇教授利用液態核磁共振結合小角度X射線散射等技術,在對人源多功能轉錄因子CTCF的結構與功能研究中取得重要進展。相關成果在線發表在《物理化學快報雜志》上。  

          多功能轉錄因子CTCF含有11個串聯鋅指,在基因表達過程中起著關鍵性的作用。它在基因組中有著多種結合位點;通過與這些不同的結合位點結合,CTCF可以使得線性的染色質成環,形成拓撲結構,并在此基礎上進一步架構為染色質的三維空間構象。雖然CTCF的11個串聯鋅指的可塑性是其識別基因組中多個位點的必要因素,但這11個鋅指的動力學性質卻未有深入研究。

          研究課題組因此將CTCF的11個串連鋅指區域作為一個整體,利用液態核磁共振的方法得到了CTCF ZFs 1-11的化學位移指認,并解析了每一個鋅指的核磁結構。據了解,這是核磁目前解析的具有最多數目結構域的蛋白質。進一步的核磁主鏈動力學、殘余偶極耦合和小角X射線散射實驗證實了在未結合核酸狀態下,CTCF ZFs 1-11具有相當的柔性。來自于原鈣粘蛋白基因簇的兩段不同DNA片段和CTCF ZFs 1-11的核磁結合實驗表明CTCF采用不同區段鋅指、以不同的結合強度進行應答;結合CTCF ZFs 1-11的化學位移指認,從而可系統性地研究染色質上的不同DNA結合位點與CTCF的互作模式。該研究對于闡釋CTCF與多種DNA結合的分子機理以及其結合過程中CTCF蛋白的構象變化有重要意義。

          論文鏈接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpclett.8b01440

          

         

          CTCT與DNA相互作用示意圖

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