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        科研進展

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        技術(shù)生物所開發(fā)完成國際上首個人類腫瘤放療增敏數(shù)據(jù)庫

        作者:溫鵬博發(fā)布時間:2018-06-05【打印】【關(guān)閉】

          日前,技術(shù)生物所趙國平研究員課題組、吳李君研究員課題組與安徽大學(xué)夏俊峰教授合作,在前期工作基礎(chǔ)上開發(fā)建立了人類腫瘤放療增敏數(shù)據(jù)庫dbCRSR(Cancer Radiosensitivity Regulation Factors Database,http://bioinfo.ahu.edu.cn:8080/dbCRSR/)。該項工作是國際上首個關(guān)于人類腫瘤放療相關(guān)基因的多組學(xué)整合數(shù)據(jù)庫,研究成果已發(fā)表在國際期刊Database: The Journal of Biological Databases and Curation上。

          放射治療是治療惡性腫瘤的重要手段之一,據(jù)統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,一半以上的癌癥患者在治療過程中會涉及到單獨或輔助性放射治療。近年來隨著影像及計算機等技術(shù)快速發(fā)展,放療的“物理精準”取得長足進步。但由于個體差異性及腫瘤異質(zhì)性,臨床放療仍面臨一些“物理精確”方法無法徹底解決的問題,例如臨床上常因正常組織耐受劑量的限制而不能給予腫瘤足夠照射劑量,造成治療失敗。因此,在分子生物學(xué)指導(dǎo)下提高腫瘤對射線的敏感性以及改善放射抗拒腫瘤的放射效果是放療發(fā)展新趨勢,放療正從“物理精確”走向“生物精準”。

          調(diào)控放療增敏可提高臨床放療的“生物精準”,dbCRSR目前已收錄了多種類型具有調(diào)控放療增敏作用的調(diào)控因子(包含395個編碼基因,119個非編碼RNA,以及306個化合物)。數(shù)據(jù)庫界面友好,用戶可根據(jù)自身需求,通過數(shù)據(jù)庫所提供的信息檢索手段,方便的獲取影響特定癌癥放療敏感的基因、藥物、調(diào)控方式,以及具有潛在放療增敏調(diào)控作用的藥物和miRNAs等多種注釋信息。

          此外,用戶還可對數(shù)據(jù)庫中的信息進行深度挖掘,如:結(jié)合基因共表達關(guān)系及蛋白質(zhì)相互作用,尋找潛在放療增敏基因;聯(lián)系多組學(xué)數(shù)據(jù),對患者的癌癥進行亞型分析,為臨床醫(yī)生進行個體化精準放療提供指導(dǎo)。dbCRSR將持續(xù)更新,并計劃后續(xù)整合更多類型的組學(xué)數(shù)據(jù),期望能逐步發(fā)展成為輻射生物學(xué)基礎(chǔ)研究和臨床轉(zhuǎn)化研究的信息知識庫。

         

          文章鏈接:

          https://academic.oup.com/database/article-abstract/doi/10.1093/database/bay049/5025485 

        dbCRSR數(shù)據(jù)庫:(A)數(shù)據(jù)庫主頁界面;(B)放療增敏領(lǐng)域的熱點基因

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